Заявляемое обозначение является изобразительным и представляет собой композицию из фигур, залитых темно-синим и светло-зеленым цветами. Изображение ориентировано вертикально и включает графические элементы, размещенные в окружности.
Логотип состоит из трех основных элементов, которые отображают консолидацию научных направлений и иллюстрируют применение информационных технологий в области экологического рационального природопользования.
Первый элемент изображён в виде двух стрелок, переходящих друг в друга. Одна из стрелок стилизована в форме зубчатого колеса (шестерёнки). Комбинация данных элементов символизирует совершенство, законченность, непрерывность развития, передачу информации и опыта в технических науках.
Второй элемент выполнен в форме листа растения, объединенного с водной волной. Данная композиция олицетворяет собой естественнонаучные исследования.
Стилизованное изображение собора Святых Апостолов Петра и Павла Петропавловской крепости является третьим элементом логотипа, располагается в центре окружности и представляет Санкт- Петербург, как научный центр России.
В основе фирменного стиля СПб ФИЦ РАН лежат 2 цвета — тёмно-синий и светло-зелёный. Тёмно-синий CMYK: 90-43-0-72, светло-зелёный CMYK: 48-0-59-0. Тёмно-синий RGB: 0-48-82, светло-зелёный RGB: 157-194-44.