El Centro Noroccidental de Investigaciones Interdisciplinarias sobre Problemas de Mantenimiento de los Alimentos es el sucesor legal del Departamento de Zona Terrestre No Negra de la RSFSR de la Academia Nacional de Ciencias Agrícolas, fue establecido de acuerdo con el Decreto del Comité Central del Partido Comunista de la Unión Soviética y del Consejo de Ministros de la URSS de 20 de marzo de 1974 № 206.
Por Decreto del Consejo de Ministros de la RSFSR, de 3 de abril de 1990, Nº 107, el Departamento de la Academia Nacional de Ciencias Agrícolas para la Zona de Tierra No Negra de la RSFSR se transformó en la rama regional de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas para la Zona de Tierra No Negra de la Federación de Rusia. En cumplimiento del Decreto del Presidente de la Federación de Rusia «Acerca de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas» de 30 de enero de 1992, № 84, se estableció la Academia Rusa Unida de Ciencias Agrícolas sobre la base de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas y la Academia Unida de Ciencias Agrícolas, a la que se transfirió la oficina regional de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas para la zona de la Tierra no Negra de la Federación de Rusia.
En relación con la liquidación de la Filial Regional de la Academia Agrícola Rusa para la zona de la Tierra Negra de la Federación Rusa y por la Orden de la Academia Agrícola Rusa de 4 de enero de 1996 № 29 se estableció el Centro Científico Noroccidental de la Academia Agrícola Rusa.
En cumplimiento de la Orden de la Academia Agrícola Rusa de 16 de noviembre de 2001 № 85, el Centro Científico Noroccidental de la Academia Agrícola Rusa se transformó en la Institución Estatal de Investigación: el Centro Científico-Metódico Noroccidental de la Academia Agrícola Rusa.
Según la Orden de la Academia Agrícola Rusa de 23 de junio de 2009 № 81 la Institución Estatal de Investigación: el Centro Científico-Metódico Noroccidental de la Academia Agrícola Rusa se convirtió en la Institución Estatal de Investigación: el Centro Científico Regional Noroccidental de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas.
En cumplimiento de la Ley Federal sobre «la Academia Rusa de Ciencias, la reorganización de las Academias Estatales de Ciencias y las enmiendas a determinados actos legislativos de la Federación de Rusia» de 27 de septiembre de 2013, № 253 y el Decreto del Gobierno de la Federación de Rusia, de 30 de diciembre de 2013, Nº 2591 el Centro Científico Regional Noroccidental de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas fue transferido a la dirección de la Agencia Federal de Organizaciones Científicas.
En virtud de la Orden del Organismo Federal de Organizaciones Científicas de 15 de diciembre de 2014 № 1320, la Institución Estatal de Investigación: el Centro Científico Regional Noroccidental de la Academia Rusa de Ciencias Agrícolas fue renombrado al El Centro Noroccidental de Investigaciones Interdisciplinarias sobre Problemas de Mantenimiento de los Alimentos.
Por el Decreto del Presidente de la Federación de Rusia de 15 de mayo de 2018 № 215: «Sobre la estructura de los poderes ejecutivos federales» y por la Orden del Gobierno de Rusia de 27 de junio de 2018 № 1293 el Centro Noroccidental de Investigaciones Interdisciplinarias sobre Problemas de Mantenimiento de los Alimentos se transfirió a la dirección del Ministerio de Ciencia y Enseñanza Superior de la Federación de Rusia.
De conformidad con la Orden del Ministerio de Ciencia y Educación Superior de la Federación de Rusia de 18 de diciembre de 2019 № 1399 el Centro Noroccidental de Investigaciones Interdisciplinarias sobre Problemas de Mantenimiento de los Alimentos se convirtió en una división separada del Centro de Investigación Federal de San Petersburgo de la Academia Rusa de Ciencias.